| 刘一贤, 周端咏, 毛超, 汪军, 黄俊生.香蕉枯萎病菌SNF1基因的克隆及生物信息学分析[J].广东农业科学,2012,39(21):160-164 |
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香蕉枯萎病菌SNF1基因的克隆及生物信息学分析 |
| Cloning and bioinformatics analysis of SNF1 gene from Fusarium oxysporum f.sp.cubense |
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| DOI：10.3969/j.issn.1004-874X.2012.21.050 |
| 中文关键词: 香蕉枯萎病菌, 生理小种, SNF1基因, 细胞壁降解酶, 致病性 |
| 英文关键词: |
| 基金项目:[国家公益性行业(农业)科研专项, 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项] |
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| 中文摘要: |
| 为了解SNF1基因在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用以及FOCl和FOC4两个生理小种之间的致病力差异关系,采用了PCR、RT-PCR的方法扩增了2个生理小种的SNF1基因,测序并采用生物信息学软件对相似序列进行搜索、比对,并对该基因编码的预测蛋白进行氨基酸序列比对和分析.研究结果显示,2个生理小种的SNF1基因的ORF分别为2 136、2 130 bp,二者相差6个碱基,同源性为99.5％.FOC1和FOC4的SNF1基因分别编码711、709个氨基酸,相差两个氨基酸,为丝氨酸(FOCl)和谷氨酰胺(FOCl).生物信息学软件预测结果表明该蛋白N端不存在信号肽,但具有两个相同的功能结构域位点,分子量约为79 ku,pI为6.80. |
| 英文摘要: |
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