文章摘要
黄冠雄1,许丹宁1,杨舒展2,郭斯璇1,曾依翎1,黄运茂1,田允波1,曹 楠1.广东省鹅细小病毒的分离及序列分析[J].广东农业科学,2018,45(5):98-104
查看全文    HTML 广东省鹅细小病毒的分离及序列分析
Isolation and phylogenetic analysis of goose parvovirus isolated in Guangdong province
  
DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2018.05.017
中文关键词: 鹅细小病毒  VP 基因  流行病学  系统发育分析
英文关键词: goose parvovirus  VP gene  epidemiology  phylogenetic analysis
基金项目:广东省科技计划项目(2017B020202010);广东省普通高校青年创新人才项目;广州市科技计划项目 (201604020061)
作者单位
黄冠雄1,许丹宁1,杨舒展2,郭斯璇1,曾依翎1,黄运茂1,田允波1,曹 楠1 1. 仲恺农业工程学院动物科技学院/ 广东省水禽健康养殖重点实验室广东 广州 510225 2. 广东省出入境检验检疫局技术中心广东 广州 510623 
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中文摘要:
      从广东省鹅主要养殖区分离出2 株鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV),分别命名为 GDQY2017 和GDYJ2017,纯化后测序分析。VP 基因的系统发育分析结果表明,2 株GPV 单独形成一 个分支,与疫苗株距离较远。选择压力分析结果表明,分离株的1 位点有强烈的净化选择。氨基酸分析 结果显示,与疫苗株相比,分离的GPV 菌株含有22 个不同的氨基酸残基,并且具有阳性选择的位点 (Arg116Gln)。
英文摘要:
      Two strains of goose parvovirus( GPV) were isolated from the main goose breeding region in Guangdong province and were named as GDQY2017 and GDYJ2017,respectively. Phylogenetic analysis of VP gene showed that 2 isolated GPV strains were clustered into one genetic group,which were far from vaccine strains. The result of selection pressure analysis showed that 1 site is subject to strong purifying selection. Sequence comparison showed that the isolated GPV strains contained 22 different amino acid residues with the positively selected site (Arg116Gln) compared to vaccine strains.
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