| 段紫英, 胡丽芳, 黄长干, 蒋伦伟, 刘世强.黄瓜EST中SSR的分布特征分析[J].广东农业科学,2012,39(22):160-162 |
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黄瓜EST中SSR的分布特征分析 |
| Analyse on character of SSR loci in cucumber ESTs |
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| DOI：10.3969/j.issn.1004-874X.2012.22.052 |
| 中文关键词: 黄瓜, EST, SSR |
| 英文关键词: |
| 基金项目:[江西省教育厅基金, 江西农业大学自由申请项目] |
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| 中文摘要: |
| 从葫芦科基因组数据库下载513 801条黄瓜EST,经EST-trimmer软件和CD-HIT程序预处理,共获得381 022条非冗余EST.利用Perl程序MISA搜索到SSR位点15 665个,检出率为4.11％.单、二和三核苷酸重复为主导类型,占EST-SSR总数的95.98％.A/T、AG/CT和AAG/CTT作为单、二和三核苷酸的优势重复基元,分别占EST-SSR总数的21.43％、15.68％和19.27％. |
| 英文摘要: |
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