| 戴世鲲，何 慧，李 涛，吴华莲，向文洲，曾海心.螺旋藻基因组中糖苷酶类基因的序列分析[J].广东农业科学,2016,43(12):115-121 |
|
查看全文
HTML
螺旋藻基因组中糖苷酶类基因的序列分析 |
| Current situation and countermeasures of integrationand development of leisure agriculture tourismindustry in Guangdong province—A case study of Conghua，Guangzhou |
| |
| DOI：10.16768/j.issn.1004-874X.2016.12.020 |
| 中文关键词: 螺旋藻 基因组 糖苷酶 |
| 英文关键词: Spirulina genome glycosidase |
| 基金项目:海南省科技兴海专项（2015XH04）；广东省海洋渔业科技与产业发展专项（A201501C09） |
|
| 摘要点击次数: 1780 |
| 全文下载次数: 1285 |
| 中文摘要: |
| ：在NCBI 基因组数据库中可检索到3 个钝顶螺旋藻藻株、1 个极大螺旋藻藻株、1 个盐泽螺旋
藻藻株和1 个螺旋藻属未定种的藻株基因组序列。6 个螺旋藻基因组序列来源的糖苷酶基因共计32 个，
编码蛋白含260～1 084 个氨基酸，BLAST 序列比对显示，与非螺旋藻种属来源的已知序列的相似性在
49%～84% 之间。系统进化分析表明，32 个糖苷酶基因聚类成8 个簇，另有3 个基因分别单独构成进化
分支。酶学功能预测显示，这些糖苷酶基因分别属于8 个糖苷酶家族（GH3、GH9、GH13、GH23、GH25、
GH38、GH57、GH104），具有8 种糖苷酶催化活性（纤维素酶、溶菌酶、α- 甘露糖苷酶、α- 淀粉酶、普
鲁兰酶、1，4-α- 葡聚糖分支酶、肽聚糖结合功能、β- 葡萄糖苷酶）。 |
| 英文摘要: |
| There are genome sequences of three Arthrospira platensis strains，an Arthrospira maxima strain，
a Spirulina subsalsa strain，an Arthrospira sp. strain in the NCBI genome database up to date. 32 glycosidase genes
can be retrieved from the 6 Spirulina genome sequences，which have 260-1 084 amino acids in length. By BLAST
analysis in GenBank，the similarity with the known sequences from the non-Spirulina species was 49%-84%.
Phylogenetic analysis indicated that the 32 glucosidase genes were divided into 8 groups，and the other 3 genes
constituted an independent evolutionary branch，respectively. The enzyme function prediction of these glucosidase
genes showed that they belonged to 8 glucosidase families: GH3，GH9，GH13，GH23，GH25，GH38，GH57，
GH104，and 8 kinds of glycosidase catalytic activity: cellulase，lysozyme，α-mannosidase，α-amylase，
pullulanase，1，4-α-glycogen branching enzyme，peptidoglycan binding function，β-glucosidase. |
|
查看/发表评论 下载PDF阅读器 |
