文章摘要
卢雅薇, 沈文涛, 唐清杰, 牛艳梅, 周鹏.番木瓜环斑病毒海南分离物全基因组结构分析[J].广东农业科学,2007,(9):54-58
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Structure analysis of the complete genome of papaya ringspot virus Hainan isolate
  
DOI:10.3969/j.issn.1004-874X.2007.09.020
中文关键词: 番木瓜环斑病毒, 全基因组, 同源性, 系统进化树
英文关键词: 
基金项目:
作者单位
卢雅薇, 沈文涛, 唐清杰, 牛艳梅, 周鹏 中国热带农科院热带生物技术研究所/热带作物生物技术国家重点实验室,海南,海口,571101 
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中文摘要:
      从感病的海南番木瓜叶片中提取总RNA,经RT-PCR和RACE方法分段扩增番木瓜环斑病毒(PRSV)全基因组序列.序列拼接结果显示,PRSV中国海南分离株(HaiNan-P)基因组除3'-末端polyA尾巴外,由10323个核苷酸组成,编码3343个氨基酸.同源性分析表明,HaiNan-P编码的氨基酸序列与GenBank中公布的11株PRSV同源性为89.8%~93.2%,略高于全长核苷酸的82.3%~89.1%.P1蛋白编码区同源性较低,仅为65.4%~80.1%,而HC-Pro、CI及CP同源性相对较高.运用MEGA 3.1软件、NJ法绘制系统进化树,分析结果显示,PRSV分离株类群分化与地理分布有一定的相关性.
英文摘要:
      
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