| 方梅霞, 周晓宁, 沈栩, 王亚军, 聂庆华, 张细权.猪繁殖候选基因JERK2的电子克隆与生物信息学分析[J].广东农业科学,2009,(10):11-15,22 |
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猪繁殖候选基因JERK2的电子克隆与生物信息学分析 |
| Electronic cloning and bioinformatic analysis of a candidate gene(ERK2)for pig reproduction traits |
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| DOI：10.3969/j.issn.1004-874X.2009.10.002 |
| 中文关键词: 猪, ERK2基因, 电子克隆, 生物信息学 |
| 英文关键词: |
| 基金项目:[农业部转基因生物新品种培育重大专项, 粤港关键领域重点突破项目] |
| 作者 | 单位 | | 方梅霞, 周晓宁, 沈栩, 王亚军, 聂庆华, 张细权 | 华南农业大学动物科学学院,广东,广州,510642
暨南大学医学院实验动物管理中心,广东,广州,510632
华南农业大学动物科学学院,广东,广州,510642
四川大学生命科学学院,四川,成都,610064 |
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| 中文摘要: |
| 利用生物信息学和比较基因组学方法对猪细胞外信号调节激酶2(Extracellular signal-regulated kinase 2.ERK2)基因的结构、表达和功能进行了分析,结果表明:(1)电子克隆获得的猪ERK2基因cDNA全长1 803 bp,包括1 080bp的编码区和200 bp 5'UTR、523 bp 3'UTR,编码合成359个氨基酸的多肽;(2)猪ERK2基因CDS序列与人、小鼠和大鼠的同源性分别为94.6%、91.6%和91.3%,编码合成的猪ERK2与人、小鼠和大鼠之间的同源性也高达99.4%、98.9%和98.9%;(3)猪ERK2蛋白的相对分子质量为41 303.69 Da,不含信号肽,具有ATP结合位点、MAP激酶保守位点和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性位点等结构域;(4)基于cDNA及EST数据库的检索显示,猪ERK2基因在卵巢、睾丸、肾上腺、眼、肺、淋巴、关节囊、副乳、未成熟的树突状细胞和脂肪细胞等组织和细胞中表达. |
| 英文摘要: |
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