余帆洋, 章群, 唐优良, 周佳怡.中华鳖线粒体遗传变异的细胞色素b序列分析[J].广东农业科学,2011,38(2):5-7 |
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中华鳖线粒体遗传变异的细胞色素b序列分析 |
Preliminary study on genetic variation of mitochondrial DNA cytochrome b gene of Pelodiscus sinensis |
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DOI:10.3969/j.issn.1004-874X.2011.02.002 |
中文关键词: 中华鳖, 细胞色素b, 遗传变异 |
英文关键词: |
基金项目:[国家自然科学基金, 留学回国人员科研启动基金, 暨南大学科研培育与创新基金] |
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中文摘要: |
测定并分析了长江水系14尾中华鳖(Pelodiscus sinensis)的线粒体细胞色素b基因1 140 bp序列,结合GenBank中下载的3个序列,发现了243个变异位点,61个简约信息位点:A+T含量(60.6%)明显高于G+C含量(39.4%);17个中华鳖序列中共存在10个单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.882,核苷酸多态性(Pi)为0.01002.在分子系统树上,17个样本共形成3个谱系,其中长江中下游出现遗传距离为0.023的2个谱系,谱系A由7个单倍型(共14尾)组成,谱系C由2个单倍型(共2尾)组成.韩国1尾单独为谱系B,与A、C谱系之间的遗传距离分别为0.030、0.031推测3个谱系问分化时间约为5百万年,建议分别加以保护.长汀中下游不同地理来源的个体混杂分布,没有形成明显的地理聚群,不同群体间的遗传变异大于群体内的遗传变异.中性检测Tajima's D和Fu's Fs均为显著负值,核苷酸不对称分布分析呈多峰型.表明中华鳖未经历过种群扩张. |
英文摘要: |
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