| 廖承红, 王华伟, 梁浩, 张建行, 韦双双, 周海龙.文昌鸡线粒体DNA控制区序列遗传多样性分析[J].广东农业科学,2012,39(12):145-147 |
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文昌鸡线粒体DNA控制区序列遗传多样性分析 |
| Genetic diversity of mitochondrial DNA D-loop sequences of Hainan Wenchang chicken |
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| DOI：10.3969/j.issn.1004-874X.2012.12.046 |
| 中文关键词: 文昌鸡, 线粒体DNA, D-loop, 遗传多样性 |
| 英文关键词: |
| 基金项目:[海南省自然科学基金, 海南省教育厅高等学校科学研究项目, 海南大学青年基金, 海南大学科研启动项目] |
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| 中文摘要: |
| 运用PCR产物直接测序的方法对海南省文昌市90只文昌鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第I高变区序列进行了分析.用CLUSTALX1.81软件进行序列比较,其中38只个体共检测到27个核苷酸多态位点,全部为转换无颠换,序列突变率为5.29％.用DnaSP软件估计出序列存在16个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.935.核苷酸多样度(π)为0.01479,平均核苷酸差异数(k)为7.541.运用Mega4.0软件计算出不同个体间的遗传距离,并据此构建了NJ系统树.文昌鸡样品在NJ无根树上聚为4大分支.研究结果表明,文昌鸡群体内个体序列变异程度较大,遗传多样性丰富,揭示文昌鸡在遗传组成上具有4个母系来源. |
| 英文摘要: |
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