| 吴海锋, 汤绮明, 苏瑛, 周松海, 谭道杰, 刘鸿, 张丽, 叶昌辉.基于生物信息学的鸡PGC1-α基因5'调控区的序列结构分析[J].广东农业科学,2012,39(23):142-145 |
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基于生物信息学的鸡PGC1-α基因5'调控区的序列结构分析 |
| Bioinformatics analysis on 5'UTR sequence properties of PGC1-α in chicken |
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| DOI：10.3969/j.issn.1004-874X.2012.23.046 |
| 中文关键词: PGC1-α, 5'调控区, 鸡, 生物信息学 |
| 英文关键词: |
| 基金项目:[广东省大学生创新实验基金, 广东海洋大学大学生创新实验基金, 广东省高等教育学会实验室管理专业委员会基金, 广东海洋大学实验研究项目] |
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| 中文摘要: |
| 利用BLAST 、Neural Network Promoter Prediction 、ORF Finder、CpG Island Searcher和TF SEARCH等在线软件预测鸡的PGC1-α基因的5’调控区的启动子、开放阅读框、CpG岛及转录因子结合位点.结果显示,鸡与其他物种的PGC1-α核苷酸序列同源性很高,达84％以上;PGC1-α基因5’调控区序列上启动子可能位于1 900 bp处；评分在85分以上时,该区域具有221个潜在的转录因子结合位点；有12个潜在的转录因子结合位点评分在95分以上；最大ORF位于1 411～1 617位核苷酸,共编码69个氨基酸；CpG岛为200 bp区间(1900～2100 bp). |
| 英文摘要: |
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