| 王兴平 1 ,罗仍卓么 1 ,李 峰 1 ,许尚忠 2 ,李俊雅 2 ,高 雪 2.牛 TRAF6基因编码区的克隆及序列分析[J].广东农业科学,2014,41(11):167-171 |
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牛 TRAF6基因编码区的克隆及序列分析 |
| Cl oni ng and codi ng s equenceanal ys i sf orTRAF6 genei n cat t l e |
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| DOI： |
| 中文关键词: 牛 TRAF6 基因克隆 信号转导 生物信息学分析 |
| 英文关键词: cat t l e TRAF6 gene cl oni ng si gnalt r ansduct i on bi oi nf or mat i csanal ysi s |
| 基金项目:国家自然科学基金( 31301943) ；湖南省自然科学
基金( 11J J 4020) ；湖南省高校创新平台开放基金( 11K045) ；湖南省
教育厅科学研究项目（12C0816）；湖南文理学院博士启动项目
( BSQD1002) ；湖南省动物学重点学科建设项目 |
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| 中文摘要: |
| 为了探讨牛 TRAF6基因的结构与功能、采用基因克隆技术分离了牛 TRAF6基因的编码区序列、并采用
生物信息学方法分析了该基因及其所编码的蛋白质的序列特征、结构和功能。结果表明院分离了 TRAF6 基因 1
803 bp 的 cDNA 序列（GenBank 登录号为 DQ471669）、编码区长度为 1 629 bp、编码 542 个氨基酸（GenBank 登录号
为 ABF06558）、位于细胞核、细胞质、线粒体、内质网等多种细胞器上、分子量为 61. 57176 ku、等电点为 6. 09、含有
RI NG-f i nger 、zf -TRAF 和 M ATH_TRAF6结构域。 该蛋白与人、小鼠和大鼠 TRAF6蛋白的同源性分别为 89% 、84% 和
82% 、 其结构域的同源性均达到 95% 以上。 根据各物种间 TRAF6 蛋白的高同源性、 结合人和小鼠 TRAF6 蛋白在
TNF/ TLRs/ TI R 超家族介导的信号转导途径中的重要作用、推测牛 TRAF6 蛋白也可能参与调节多种信号通路、在免
疫反应、炎症反应、细胞分化和凋亡等生物学过程中发挥重要功能。 |
| 英文摘要: |
| :I n or dert o cl ar i f y t he st r uct ur e and f unct i on ofbovi ne TRAF6 gene,t he codi ng r egi on sequence ( CDS)of
TRAF6 gene ofdi ar y cat t l e wasi sol at ed by gene cl oni ng t echnol ogy,and i t schar act er ,st r uct ur e and f unct i on wer e anal yzed
by bi oi nf or mat i csmet hods .The r esul t sshowed t hat1 803 bp cDNA ( GenBank I D:DQ471669)ofcodi ng sequence ofcat t l e
TRAF6 gene wasi sol at ed,whi ch i ncl uded t he compl et e 1 629 bp CDS,coded 542 ami no aci ds ( GenBank I D:ABF06558) ,
and l ocat ed on many cel lor gans ,i ncl udi ng cel lnucl eus ,cyt opl asm,mi t ochondr i a and endopl asmi c r et i cul um.The mol ecul ar
wei ghtand i soel ect r i cpoi ntofdi ar ycat t l eTRAF6 pr ot ei n wer e61. 57176 ku and 6. 09,r espect i vel y.TRAF6 pr ot ei n cont ai ned
sever aldomai ns i ncl udi ng RI NG -f i nger ,z f-TRAF and M ATH_TRAF6.The homol ogi es ofTRAF6 pr ot ei n bet ween di ar y
cat t l e and human,mouse,r at swer e 89% ,84% and 82% ,r espect i vel y.The homol ogi esofpr ot ei n domai n among al lspeci es
ment i oned abovewer e up t o95% .Accor di ngt her esul t sand t hekeyf unct i onsofTRAF6 pr ot ei n f ormanysi gnalt r ansduct i on
pat hwaysmedi at ed by TNF/ TLRs / TI R superf ami l i esi n human,i tcoul d i nf ert hatdi ar y cat t l e TRAF6 mi ghtbe an i mpor t ant
si gnalmol ecul arf orr egul at i ng manysi gnalt r ansduct i on pat hways ,and mi ghtbe ser ved asver y i mpor t antf unct i onsf ormany
bi ol ogi calpr ocesses ,l i kei mmuner esponse,i nf l ammat i on,cel lapopt osi sand di f f er ent i at i on. |
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