| 黄琼林1，何 瑞2，3，詹若挺2，3.青天葵HMGR 基因片段的鉴定
和生物信息学分析[J].广东农业科学,2015,42(21):140-144 |
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青天葵HMGR 基因片段的鉴定
和生物信息学分析 |
| Identification and bioinformatics analysis ofHMGR gene fragment in Nervilia fordii |
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| DOI： |
| 中文关键词: 青天葵 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A 还原酶 生物信息学 功能鉴定 表达分析 |
| 英文关键词: Nervilia fordii（Hance）Schltr. 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase bioinformatics functional identification expression analysis |
| 基金项目:国家自然科学基金（30701090）；广东省
自然科学基金博士启动项目（2015A030310519）；广东医
学院博士学位人员科研启动项目（B2013017） |
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| 中文摘要: |
| 采用生物信息学对青天葵转录组测序获取的3- 羟基-3- 甲基戊二酰辅酶A 还原酶编码基因片
段NfHMGR 及其编码蛋白进行功能鉴定和表达分析。结果表明，NfHMGR 基因片段序列长度为1 563 bp，与其
他植物HMGR 基因的同源性最高可达88%；编码含有521 个氨基酸、分子量约为55.34 ku 的亲水性不稳定蛋
白。NfHMGR 蛋白具有3- 羟基-3-甲基戊二酰辅酶A 还原酶Ⅰ类酶功能域，归属于3-羟基-3-甲基戊二酰辅
酶A 还原酶超级家族，包含3 处跨膜结构域，不含任何信号肽、转运肽，二级结构表现为混合型结构蛋白质。
在青天葵不同组织中，NfHMGR 基因在球茎中的表达量高于在叶片中的表达量。 |
| 英文摘要: |
| A gene fragment of 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase（HMGR）was identified
from the transcriptome of Nervilia fordii（Hance）Schltr. and analyzed using bioinformatics. The results showed that
NfHMGR embodied 1 563 bases and shared high homology with other plants，which was up to 88%. NfHMGR encoded an
unstable and hydrophilic protein that contained 521 amino acids and exhibited a molecular weight of 55.34 ku. NfHMGR
protein，which was assigned to 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase superfamily，embraced 3-hydroxy-
3-methylglutaryl coenzyme A reductase Ⅰ functional domain，three transmembrane regions and none signal peptide and
transport peptide. Secondary structure prediction revealed NfHMGR was a hybrid protein. And NfHMGR gene expressed
higher in corm than in leaf. |
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