王 振1,申小云2,3,盘道兴1,谢海强1,刘若余1.威宁绵羊和贵州半细毛羊FecB 基因SNP 分析[J].广东农业科学,2016,43(1):130-135 |
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威宁绵羊和贵州半细毛羊FecB 基因SNP 分析 |
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中文关键词: FecB 基因 威宁绵羊 贵州半细毛羊 单核苷酸多态性(SNP) |
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利用威宁绵羊和贵州半细毛羊构建DNA 池,设计11 对引物扩增其FecB 基因外显子和部分内含
子的序列,对纯化后的PCR 产物双向测序,分析确定多态性位点。然后利用生物信息学软件分析SNPs 位点
对FecB 基因RNA 二级结构、FecB 蛋白结构的影响。结果显示,在扩增的FecB 基因中筛选到10 个SNPs,其
中exon5-A39G、exon9-C37A、exon11-C87A、intron2-A62G、intron4-A1023G、intron10-G24A 突变为威宁绵羊
和贵州半细毛羊中所共有,而exon9-A8G 和intron1-G243A 突变为威宁绵羊所特有,intron3-G177A 和exon8-
T86C 突变为贵州半细毛羊所特有。上述的SNPs 中,exon5-A39G 和exon9-A8G 为错义突变,exon5-A39G 突变
导致编码的异亮氨酸(Ile)变为缬氨酸(Val),exon9-A8G 突变导致编码的天冬酰胺(Asn)变为天冬氨酸
(Asp); exon9-C37A 和exon11-C87A 多态位点均未改变氨基酸的编码,为同义突变。 |
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