蔡紫玲,刘琪司,林 同.松墨天牛转铁蛋白基因克隆及生物信息学分析[J].广东农业科学,2016,43(4):117-123 |
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松墨天牛转铁蛋白基因克隆及生物信息学分析 |
Cloning and bioinformatics analysis of transferringgene of Monochamus alternatus |
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DOI:doi:10.16768/j.issn.1004-874X.2016.04.023 |
中文关键词: 松墨天牛 转铁蛋白 生物信息学 结构域 |
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转铁蛋白是一类非血红素结合铁的β1– 球蛋白,广泛分布于脊椎动物和无脊椎动物体内。克隆了松墨天牛转铁蛋白基因(登录号:KU213914),命名为MaTf,其核苷酸序列全长为2 549 bp,包含一个2 178 bp 的开放阅读框(ORF)和一个371 bp 的带有加尾信号的3' 非编码区(3'UTR)。采用生物信息学方法分析MaTf 的编码蛋白,结果显示:松墨天牛转铁蛋白分子量约为80 ku,等电点为7.36,为稳定蛋白,有信号肽,不含跨膜结构域有1 个糖基化位点,有平均分布在整条肽链的43 个磷酸化位点。二级结构多为随机卷曲,仅有21.52%α 螺旋,24%β 片层(延伸链)结构,能形成三段卷曲螺旋,为亲水性蛋白,N 端和C 端各有1 个TR_FER 结构域。 |
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