傅明骏1,2,吴 松1,3,唐 蕾1,4,周发林1,邱丽华1,江世贵.斑节对虾泛素融合蛋白UbL40 基因
的克隆及表达分析[J].广东农业科学,2016,43(4):144-150 |
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斑节对虾泛素融合蛋白UbL40 基因
的克隆及表达分析 |
Molecular characterization and expression profiles of UbS27gene from black tiger shrimp( Penaeus monodon) |
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DOI:doi:10.16768/j.issn.1004-874X.2016.04.027 |
中文关键词: 斑节对虾 泛素融合蛋白L40 卵巢发育 基因克隆 |
英文关键词: |
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中文摘要: |
从斑节对虾(Penaeus monodon)肝胰腺转录组数据中筛选获得泛素融合蛋白UbL40 基因(ubiquitin/ribosomal L40 fusion protein,PmUbL40)的部分序列,利用RACE 技术克隆其cDNA 全长序列,通过生物信息学进行结构分析;利用实时定量PCR 技术检测该基因在斑节对虾不同组织及卵巢不同发育期的表达情况。结果表明,PmUbL40 基因cDNA 全长571 bp,开放阅读框(Open reading frame,ORF)长390 bp,编码129 个氨基酸,预测分子量约14.7 ku,理论等电点为9.76。预测氨基酸序列的N- 末端(1~76aa)为高度保守的泛素结构域,C- 末端(77~129aa)为典型的核糖体蛋白L40 结构域。多重序列比对表明不同物种的UbL40在进化过程中高度保守。实时定量PCR 结果显示PmUbL40 基因在肝胰腺的表达量最高,肌肉、卵巢次之,其他组织的表达较低;在卵巢发育过程中PmUbL40 基因在II 期表达最高,其次是V 期,显著高于I、III、IV 期。
研究结果表明PmUbL40 基因在斑节对虾卵巢发育过程中可能具有重要作用。 |
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