李冬梅, 吕复兵, 朱根发, 洪彦彬, 陈小平, 梁炫强, 操君喜, 孙映波.蝴蝶兰EST资源的SSR信息分析[J].广东农业科学,2011,38(3):117-120 |
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蝴蝶兰EST资源的SSR信息分析 |
Analysis of SSR information in EST resource of Phalaenopsis spp. |
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DOI:10.3969/j.issn.1004-874X.2011.03.044 |
中文关键词: 蝴蝶兰, EST, SSR信息 |
英文关键词: |
基金项目:[广东省农业攻关项目, 广东省农业科学院支撑计划项目] |
作者 | 单位 | 李冬梅, 吕复兵, 朱根发, 洪彦彬, 陈小平, 梁炫强, 操君喜, 孙映波 | 广东省农科院花卉研究所/广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室,广东,广州,510640 广东省农科院作物研究所,广东,广州,510640 |
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中文摘要: |
对5 472条蝴蝶兰无冗余EST序列进行了SSR搜索,共检索出 376条EST含有419个SSR位点,平均每7.4 kb EST序列出现1个SSR.共有60种SSR的重复基元.其中二核苷酸和三核苷酸重复基元占丰导地位,分别占SSR总数的67.1%和30.3%:AG/CT在SSR基元中出现频率最高(46.1%).AT/AT次之(18.6%).根据搜索结果设计了 100对蝴蝶兰EST-SSR引物,并随机合成了20对引物以2个蝴蝶兰品种的DNA为模板,对引物进行了筛选和评价,有16对引物扩增出稳定且清晰的目标产物,其中12对引物扩增的产物存在多态性. |
英文摘要: |
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