袁晓龙 1,2,徐丹同1,曹浩男1,熊浩铭 1,曾检华 3,陈子韬 1,张 哲 1,李加琪 1.杜洛克母猪初情期日龄全基因组关联分析[J].广东农业科学,2020,47(5):92- |
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杜洛克母猪初情期日龄全基因组关联分析 |
A Genome-wide Association Study for Age at Puberty of Duroc Pig |
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DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2020.05.012 |
中文关键词: 杜洛克猪 初情期 全基因组关联分析(GWAS) 候选基因 |
英文关键词: Duroc sows puberty genome-wide association study(GWAS) candidate genes |
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中文摘要: |
【目的】母猪初情期日龄是重要的经济性状,直接影响母猪的繁殖利用年限,但调控母猪初情期启动的机制尚不清楚。【方法】基于全基因组芯片数据,对 571 头杜洛克母猪初情期日龄进行全基因组关联分析,筛选影响母猪初情期日龄的重要基因。【结果】571 头杜洛克母猪的初情期日龄符合正态分布,初情期日龄最早为 173 d,最晚为 291 d,平均为 224 d;初情期越早的母猪表现出更高的窝产仔数和平均窝重;通过质控,共有 30 281 SNP 位点被用于全基因组关联分析,在前 10 个潜在 SNP 位点附近,找到 ABCC8、BCAR3、NELL2 和 NSF 等基因,这些基因的主要功能富集在 ATP binding、第二性征发育、激素分泌的调控方面。【结论】初步筛选了影响母猪初情期日龄的基因,但具体功能需要进一步研究确认。此研究不仅能为解析母猪初情期启动的遗传机制提供参考,还能为母猪初情期日龄的遗传改良提供一定的理论基础。 |
英文摘要: |
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